Archive pour août, 2020

Covid 19 Analyse semaine 34

L’analyse des données du nombre de nouveaux cas a de quoi inquiéter: 

Covid s34 donnees brutes

 

Cette courbe semble prendre une allure exponentielle….

En fait, il faut toujours retraiter  les données et les analyser sous plusieurs formes avant de conclure  

Si on tient compte du nombre de tests qui , en augmentant , peut fausser une première impression, on obtient la courbe suivante:   

 

Covid s34 pos simul

Cette courbe du nombre de cas positifs détectés pour 100 tests montre un changement du rythme de croissance à partir du 03/08. La progression reste linéaire au rythme de 0,1 point de pourcentage par jour , soit quand même 4 fois plus vite que pendant la période du 7/07 au 03/08 !!!! Mais la progression reste linéaire , ce qui est plutôt rassurant.

Ces changements de rythme se produisent chacun  à une date précise qu’il est à ce jour difficile d’expliquer. 

Contrairement à ce qu’il s’était passé au mois de mars où seulement trois régions avaient été particulièrement  touchées, actuellement toute la France est concernée, avec ponctuellement quelques épisodes localement et temporairement marqués, comme la Mayenne dernièrement.

Covid 19 s34 vosges

On peut trouver aussi quelques départements qui se distinguent , comme les Vosges, où la tendance est à la réduction des cas…. mains ils sont très rares..

 

Malgré l’accroissement très important de nouveaux cas, les hospitalisations restent faibles. Une tendance à la hausse se fait malgré tout sentir depuis mi-juillet.

Covid S34 si  hosp

 

On constate que la proportion de cas de Covid qui vont se retrouver hospitalisés continue à diminuer lentement : 

 

Covid s34 hospi

On atteint maintenant un niveau de 5% de cas de Covid hospitalisés.

Outre le fait que la proportion de jeunes infectés augmente régulièrement, il vient de sortie des études qui montreraient qu’une mutation du  virus rendrait ses attaques moins sévères.

Les données actuelles en France ne vont pas dans ce sens.  La courbe ci-dessus d’entrées en soins intensifs progresse plus rapidement que la courbe des entrées en hospitalisations depuis mi-août.

D’autre part les indications des experts intervenants dans les émissions radio et TV sur le Covid-19 indiquent , rassurants, qu’on saurait mieux prendre en charge les patients. Là non plus  les données disponibles ne semblent pas confirmer.

Le graphique suivant rassemble les deux courbes du nombre de nouvelles admissions en soins intensifs et de décès.

 

Covis s34 deces

Si on décale de 18 jours la courbe des décès( relevés verts) on constate une très grande similitude entre les deux courbes depuis le 19/05. Qui plus est les valeurs sont au même niveau !!!! Comme si 100% des admis en soins intensifs n’avaient aucune chance de survie 18 jours  après!!!!!

On aurait besoin d’éclaircissements pour pouvoir interpréter ces données….

Est-ce que ces 18 jours représentent  le temps moyen de séjour en soins intensifs?? On entendu parler quelques fois de 3 semaines, cela correspondrait. 

Combien de décès se produisent sans passage en soin intensifs et pourquoi? Quelle est la proportion de patients qui guérissent après un passage en soins intensifs ? Ce sont des sujets qui ne sont pratiquement jamais abordé dans les émissions sur la Covid-19….. Le Pr Gilles Pialloux l’a évoqué très timidement dans une récente émission, mais la journaliste n’a pas saisi l’opportunité d’approfondir ce thème…… Trop sensible. 

Covid 19 situation au 06/08/2020

Bilan de la situation de la pandémie du Covid 19 au niveau national au 06/08/2020

Regardons d’abord l’évolution du taux de résultats positifs pour 100 tests.

Covid 08 France cas positifs pour 100 tests

Le nombre de tests, qui a plus que doublé depuis la sortie du confinement,  n’a pratiquement pas d’influence sur ce paramètre

On peut isoler trois séquences principales qui ont été  simulées  par des droites de couleurs différentes :

           - La première ( couleur verte ) située entre le déconfinement et le 29/05 représente une réduction du taux de cas positifs de 0,084 point de pourcentage par jour!!! Ce rythme est le résultat du confinement. A ce rythme la Covid aurait pu disparaître le 15/06,  théoriquement , bien entendu!!!

- A partir du 29/05 on constate un redémarrage de la Covid  puis l’évolution se stabilise autour d’un rythme de réduction de 0,02 point de pourcentage par jour ( droite bleue) . La baisse se poursuit sur ce rythme  jusqu’au 7/07. J’ai signalé dans un article précédent cette date du 07/07 sans découvrir quels événements pourraient être à l’origine de ce changement. 

        – A partir du 7/07  ( droite rouge) on est sur un rythme de 0.025 point de pourcentage de hausse par jour. Cette progression est constante  et semble inexorable.  Est-ce que la pression des autorités, tant politiques que médicales, sur l’utilisation plus étendue des masques va avoir un impact sur ce rythme de hausse ? Les deux prochaines semaines devraient pouvoir nous apporter un début de réponse. 

 

Covid 08 France Données hospitalières

 

Parallèlement à la hausse des cas positifs détectés on constate une progression très lente mais notable de la hausse du nombre de nouvelles admissions en hospitalisation et en soins intensifs depuis mi-juillet environ. Cette hausse encore faible commence tout juste à compenser les sorties  de soins intensifs des personnes entrées quelques semaines plus tôt.  La décrue du nombre de personnes hospitalisées pour Covid 19 se poursuit encore , tout en se ralentissant. 

Pourtant, avec l’augmentation du nombre de tests on découvre  beaucoup plus de cas positifs qu’à la sortie du confinement:  2 000 de plus par semaines!!!;Covid 08 France cas positifs

 

En pratique , si on regarde la proportion de cas positifs qui sont hospitalisés on s’aperçoit que cette proportion a été divisé par 5 depuis le 19/05:

 

Covid 08 France hospit vs cas

 

Ce résultat est probablement le résultat d’au moins deux  évolutions depuis le 19/05

                   - Le protocole de recherche de personnes possiblement contaminées par contact avec des positifs déjà identifiés  a été beaucoup  développé. Cela conduit à augmenter la proportion des cas positifs peu ou pas symptomatiques ne nécessitant pas d’hospitalisation

                 - Le nombre jeunes ne développant pas de forme graves augmente aussi. Pour la tranche 0-39 ans, la proportion se situe au niveau de 60% actuellement ( voir données indiquées dans l’analyse sur la Mayenne)  

Tous ces éléments sont plutôt rassurants, mais il faut toujours se méfier des modes de présentation des données . Ainsi la représentation de la situation en proportion du nombre d’habitants par département ou régions semble plus alarmante:

Covid 08 Depart et regions positifs

 

Les données de ces zones indiquées ici ( pas particulièrement sélectionnées) montrent que le nombre de cas positifs pour 100 000 habitants sont systématiquement supérieures à leur niveau de sortie de confinement!!! . C’est ce qui a pu faire dire à certains commentateurs qu’on avait épuisé notre marge de sécurité durement obtenue par le confinement…. C’est une vue plutôt pessimiste mais pas totalement erronée.

 Ce graphique montre aussi comment se présente un emballement local de la maladie dans l’exemple ici de la Meurthe & Moselle: l’accroissement de cas est extrêmement rapide et il faut réagir très vite pour limiter l’extension du problème. La majorité des membres du corps médical insistent beaucoup, avec raison, sur la vitesse de réponse. Mais il faut bien prendre conscience que plus le nombre de cas augmente , plus le personnel en charge des tests et du suivi est chargé , surtout pendant cette période de congés, plus il va être être difficile pour lui de réagir rapidement. 

       Ne comptons pas sur les autres pour contenir cette maladie, les actions de chacun de nous ont à tout moment  une incidence  sur l’évolution de la COVID 19

 

Covid 19 Mayenne retour à la normale ?

Point de la situation en Mayenne au 02/08

Le taux de positivité ( nombre de cas positifs sur 100 tests) est retombé ces derniers jours au niveau actuel de l’ensemble de la France ( hors Guyane) 

 

Mayenne 08 02  taux positifs

Peut-on en déduire que tout est redevenu normal dans ce département pour autant? 

Voyons d’autres critères :  

Tout d’abord le taux de nombre de tests positifs sur 7 jours ramené à 100 000 personnes appelé aussi taux d’incidence 

Mayenne 08 02 taux de tests

 

 

Ce taux vient juste de passer sous le seuil des 50 qui sépare la zone d’alerte te la zone de vigilance. Le retour à la normale n’est pas encore totalement acquis, mais il est sur la bonne voie.On peut penser que le taux de test très élevé de 4 400 pour 100 000 habitants a contribué à maîtriser cette infection.

La proportion de positifs admis en hospitalisation était alors environ trois fois plus faible en Mayenne qu’en France. 

Mayenne 08 02 hospi

On peut constater qu’une fois passé le pic d’infection vers le 26/07 l’écart sur ce critère entre la Mayenne et la France s’est mis à se réduire pour  pratiquement se rejoindre alors que la situation tend à se  »normaliser » : le niveau de cas positifs ( sur 7 jours glissants) est maintenant trois fois plus faible qu’au pic de l’infection

Voyons ce qu’il en est de la proportion de jeunes (0-39 ans) parmi les positifs:

Mayenne 08 02 taux de jeunes

Du 14 au 20 Juillet, quand le nombre de cas positifs se situait aux alentours de 200 , la proportion de jeunes positifs ( 0-39 ans) dans l’ensemble des personnes infectées était aux environs de 70%  contre 53% pour le reste de la France. Dès que le nombre de cas s’est mis à  »exploser », la proportion de jeune a progressivement diminué pour tomber à 50% le 30/07, puis elle remonte maintenant pour rejoindre le niveau France qui entre temps a atteint le niveau de 60%… Encore sur ce paramètre la Mayenne arrête de se distinguer….

Je ne sais pas quel est le niveau de signification de ces derniers paramètres, mais le fait que l’ensemble de ces indicateurs tend à montrer que la situation de la Mayenne tend à rejoindre la  moyenne Française est rassurant quand à l’évolution de la situation en Mayenne.

Reste à interpréter ces variations importantes de taux d’hospitalisation et de % de jeunes dans la population infectée: On sait que les jeunes respectent moins les gestes barrières et ne sont pas particulièrement assidus au port du masque. Comme ils sont moins exposés aux formes graves nécessitant une hospitalisation ,  ces variations observées peuvent en partie seulement se comprendre, ce rapport de 3 semble disproportionné et se maintien jusqu’au 26/07 alors que la proportion de jeunes infectés rejoint la moyenne Française.Par ailleurs, la chute de 70% à 50% de la proportion de jeunes infectés sur la période du pic d’infection est surprenante et pas évidente à interpréter

N’hésitez pas à me proposer une interprétation , je suis preneur.

   

 

 

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