Archive pour juillet, 2020

Covid-19 Mayenne que se passe-t’il?

Mayenne: analyse au 20 Juillet 

L’épidémie de Covid-19 a débuté il y a plus de trois semaines en Mayenne et il n’y a aucun indice qui laisse à penser que la maîtrise de cette épidémie soit proche. Le taux de tests atteint des records,:le niveau de 3000 tests semaine pour 100.000 habitants est en vue  et le taux de positifs pour 100.000 continue à augmenter, comme le montre la figure ci-après.

Mayenne taux tests

 

Regardons plus en détail ce qu’il se passe: 

Le nombre effectif de cas positifs à été reporté sur le graphique suivant:

Mayenne nombre hospi cas positifs

Le nombre de nouvelles hospitalisation correspondant est aussi reporté sur ce même graphique. on observe une grande similitude dans les deux courbes. Cela signifie que, dans le contexte local actuel, le décalage entre les variations du nombre de cas positifs et du nombre d’entrées en hospitalisation estimé habituellement à 8 à 10 jours a totalement disparu???

De plus si on compare le rapport entre le nombre de nouvelles hospitalisations et nombre de cas positifs  pour la France entière et la Mayenne on constate une différence très significative: 

Mayenne hospi vs cas positifs

Jusqu’au 28/06 les nombres de cas positifs et d’hospitalisation sont très faible pour la Mayenne  , ce qui rend ce rapport instable très variable et peu significatif. Par contre depuis début Juillet ce rapport s’est stabilisé  à 0.05  soit  5% en Mayenne et à 0,15 soit 15 % pour la France entière soit un ratio de 3!!!! 

D’où peut bien venir cet écart?

Une analyse de la semaine glissante du 14/07 au 20/07 montre qu’en Mayenne la tranche d’age 0 – 39 ans représente 70% des cas positifs, alors que cette même tranche d’age ne représente que 53% des cas sur la France entière.

On sait que plus les personnes positives sont jeunes moins elles développent des formes graves, est-ce suffisant pour explique un tel écart?   pas sûr. 

Par contre le fait qu’une très forte proportion de jeunes soit positive en Mayenne peut expliquer la difficulté à maîtriser localement l’épidémie: En effet les personnes jeunes sont proportionnellement soit asymptomatique soit très peu symptomatique et ne sont pas particulièrement motivés pour se faire tester, donc beaucoup de jeunes sont contagieux et transmettent le virus dans la population sans qu’il soit possible de les isoler. Comme en plus ils rechignent à porter un masque, il sera vraiment difficile de ramener la circulation du virus à un niveau moyen acceptable.

L’historique du taux de positivité en Mayenne   ( nombre de cas positifs pour 100 test)  montre qu’après avoir atteint un palier au niveau de 8 , on a enregistré une chute puis un rebond vers 5,5. Un palier à 3 semble atteint maintenant. A titre de comparaison le niveau pour la France entière est de 1.2 ces derniers jours  et il progresse lentement mais inexorablement

 Mayenne  taux positif vs tests  

 

Le volume de tests est actuellement très élevé, on va très prochainement dépasser le record de 3000 tests pour 100.000 habitants  soit 4 fois le taux actuel moyen France entière….Cet effort au niveau des tests devra être accompagné d’un respect plus strict des gestes barrières et surtout du port du masque par le plus de personnes possibles. 

En cas d’échec c’est un reconfinement local qui s’imposera!!!!!

 

Covid 19 date du 07/07/2020

J’ai rassemblé sur le graphique ci-après les derniers relevés du taux d’incidence ( Nombre de personnes testées positives sur 100 000) pour quelques départements.

Date du 2020 07 08

 

 

On peut noter que sur tous les 5 départements sélectionnés ici, le taux d’incidence s’est mis à augmenter à compter de la même date du 07/07 dernier. 

Cette hausse n’est probablement pas fortuite: Serait-elle liée à la fête de la musique du 21/06? cela semble peu probable : 18 jours est un temps trop long pour le temps d’incubation de la Covid , par contre 11 jours après la campagne et le vote du second tour des municipales , cela parait plausible. En général beaucoup de précautions ont été prise pour les opérations de vote, par contre  il y a eu un très important relâchement à la diffusion des résultats!!!!! Paye-t’on cela???

Remarque : Certains autres départements ne présentent pas cette augmentation, et je n’ai pas analysé tous les départements. 

 

Covid 19 La pandémie en Guyane

Mise à jour du 16/07

La situation en Guyane est alarmante : 1/3 des nouveaux cas de Covid 19 en France (Dom-Tom compris) se situent en Guyane alors que la population locale n’est que de 300 000 habitants. Le  niveau de taux de positifs a culminé ces derniers jours à 470 pour 100 000 habitants sachant que le premier niveau de seuil : le seuil de vigilance est de 10 et que le deuxième niveau : le seuil d’alerte est de 50…..

.   Guyane 2020 07 15

 

 

Sur cette même figure j’ai reporté le taux de tests cumulé sur 7 jours glissants ramené à une population de 100 000 personnes, en même temps que le taux de cas positifs. On constate un parfait parallélisme entre les deux courbes jusqu’au 07/07. Pendant près de 3 semaines plus on a testé, plus on a trouvé de cas positifs. A partir du 07/07 le taux de cas positifs s’est mis à diminuer indépendamment du taux de test, ce qui est encourageant, Rien n’est gagné pour autant , le taux de cas positifs étant encore largement au dessus du plafond de 50….

Un autre paramètre étudié est de taux de positivité , c’est à dire  le nombre de cas positifs sur 100 tests effectués. Les seuils pour ce paramètre sont 5% pour le seuil de vigilance te 10% pour le seuil d’alerte

 

Taux de positivite 2020 07 15

 

Jusqu’au 07/07 le taux de positivité est resté proche des 25%, c’est le niveau qu’on a connu en France métropolitaine au plus fort de la crise début avril…. Cela situe l’état critique de la situation en Guyane. Espérons que ce taux va continuer à diminuer contrairement à ce qu’il se passe en Mayenne.

En effet en Mayenne, le taux de positivité est monté aux environs de 8, ce qui le situait dans la zone de vigilance, pour ce critère. Il a ensuite amorcé une descente , puis vers le 07/07 il s’est stabilisé puis s’est mis à remonter ???? 

Pendant cette période le taux de tests n’a cessé de’augmenter pour atteindre le niveau de 1000 tests par semaine pour 100 000 habitants , ce qui représente l’équivalent de près de 700 000 tests semaine appliqué à  la France entière…. Objectif affiché de capacité de test, mais atteint que localement. Le niveau actuel France entière est à 380 000 

Mayenne 2020 07 15

On peu noter , tant dans le cas de la Guyane que dans le cas de la Mayenne que ce niveau de test de 1000 ( sur 7 jour sur 100 000 personnes) n’est pas réellement suffisant en cas de pandémie. La  Covid 19 à continué  à progresser en Guyane et continue à gagner du terrain en Mayenne….; C’est vers 1800 tests pour 100 000 personnes qu’il semble qu’on ait pu maîtriser la pandémie en Guyane,et seulement au bout de 10 jours!!!. 

Espérons que la Mayenne  ne devienne pas un  foyer incontrôlé qui pourrait être la source d’une propagation plus large…. Il est prévu d’augmenter encore le nombre tests sur place, souhaitons que cela sera suffisant.

Cela nous interpelle aussi sur la difficulté qu’il pourrait y avoir à maîtriser une  »seconde vague » en France métropolitaine, si elle se déclenchait…..

 

                                                             RESTONS PRUDENTS, Appliquons les gestes barrières et portons des masques

Covid-19 analyse Juin 2020

Dans mon précédent article je craignais une reprise de la pandémie  en France au vu de l’évolution du nombre de nouveaux cas:

L’ensemble des relevés de Juin 2020 confirme cette tendance pour la France y compris DOM-TOM : voir relevés ci-après

 

Civid juin2020 nouveaux cas

En fait une analyse plus détaillée montre que cette augmentation du nombre de nouveaux cas a pour origine essentielle la Guyane.  Région où la situation épidémique est particulièrement critique.  

Hors Guyane, l’évolution pour la France est tout à fait rassurante.

Ces résultats montrent bien qu’un seul secteur ,même avec une population réduite ( 300 000 habitants en Guyane), où le virus n’est pas bien contrôlé peut poser de gros problèmes. 

On le constate aussi chez nos voisins Européens où des confinements locaux sont mis en place, comme en Allemagne  ou au Portugal , pourtant pays peu atteints jusqu’à présent…..  

 

En regardant plus en détail ces relevés de Juin 2020 on constate deux discontinuités  le 8 juin et le 29  juin

Les relevés des nombre de tests effectués: figure ci-après 

Covid juin 2020 tests

confirment qu’à ces deux dates le nombre total de tests a été augmenté. Ceci confirme que toute variation du nombre de nouveaux cas doit être analysée finement avant d’avancer une conclusion quelconque.

L’augmentation des tests à compter du 29 juin a été abondamment commentée concernant l’Ile de France. En fait dans le détail on constate que d’autres régions aussi ont augmenté leur nombre de tests. Cette initiative est plutôt bien venue au début de la période de congés. En effet cela devrait permettre de réduire le nombre de porteurs asymptomatiques de virus et donc de réduire le risque de nouveaux foyers au moment où les mouvements de populations s’accélèrent et où le déconfinement s’élargit.   

 Complément d’analyse 

La première semaine de Juillet permet de préciser ce que peut être une analyse plus fine de la situation.

On constate sur la courbe suivante que du 05/07 au 07/07 le nombre de test a continué à augmenter  mais que le nombre de cas positifs commence à diminuer  

Positifs & tests

 

Une façon de mieux comprendre ce qu’il se passe est d’étudier le nombre cas positifs ramené à 100 tests.

Les résultats sont reportés sur la courbe suivante 

Pourcent positifs

 

 Le pourcentage de cas positifs décroit régulièrement. Après avoir concentré la recherche cas autour des  »cas contact » d’un malade avéré, maintenant on ajoute une détection plus au hasard. Celle-ci se révèle  moins efficace pour trouver des personnes infectées, d’où la chute du % de positifs. 

Ce résultat est doublement rassurant:

    D’une part le méthode des recherches  par analyse des  »cas contact » se confirme être la plus efficace 

              D’autre part le taux de porteurs asymptomatiques ou qui ne se déclarent pas est très faible. Et il n’y a pas d’indice que ce taux soit en augmentation. L’augmentation annoncée du nombre de test devrait le confirmer.  

Il ne faut pas pour autant  de relâchement dans les gestes barrières ou le port du masque. Le cas de la Mayenne est l’exemple très spectaculaire à cet égard 

Mayenne

 

En moins de 10 jours le taux de personnes infectées localement a été multiplié par 20 !!!!! Si les personnes infectées n’avaient pas été détectées et confinées rapidement, en se déplaçant, ces personnes auraient pu propager le virus très rapidement dans le reste de la France. On sait aujourd’hui que ce sont deux situations similaires détectées trop tardivement  qui ont déclenché l’explosion de mars dernier à Crépy en Valois et Mulhouse….. 

Conclusion

Notre déconfinement actuel tient à deux choses très importantes:

          L’aptitude de chacun de nous à éviter de participer à la propagation du virus en faisant tout pour s’en protéger. 

          La capacité de notre système de surveillance et de tests à détecter les foyers d’infection le plus tôt possible et à isoler les porteurs.

 

Note: La Guyane se trouve en situation très délicate. Je prépare une analyse spécifique.  

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